滴眼藥水是治療眼病的主要手段之一，為了提高療效、減少副作用和節約用藥，掌握正確滴用眼藥水的方法很有必要。
眼藥水滴用前應先搖勻，并在光線下觀察是否變質（變混濁或變色），否則應停止使用。每只眼僅能容納相當于1/3滴（20微升）藥液，所以每次只要滴一滴眼藥水已足夠了。
滴眼藥時，滴管的頭不要接觸到睫毛，以免引起反射性眨眼，使藥液不易滴進眼內，同時也可防止睫毛上的細菌污染眼藥，特別是集體使用的藥液。
幾種藥液不能同時滴用，以防互相稀釋，降低療效。應該在滴用一種藥液后雙眼閉合10分鐘，再使用另一種，這樣每種藥液都能發揮最大效力。
滴藥液后，因眼淚的稀釋作用，20分鐘后濃度已降低。因此，患急性結膜炎、角膜潰瘍或其他急性眼病時，應每隔半小時左右滴用一次；如是慢性結膜炎等慢性眼病，每天滴3-4次已足夠。某些藥物作用時間維持較長，如阿托品藥液，每天滴用1-2次即可。
有些人滴眼藥水后頻頻眨眼，是不對的，因為眨眼除把藥液擠出外，還會使藥液很快通過淚小管而流向鼻腔，使藥液發揮療效的時間大大縮短，所以滴眼藥后應該雙眼自然閉合10分鐘，使藥液充分被眼組織吸收。
為使夜間睡眠時藥物仍能發揮作用，臨睡前可涂眼藥膏一次。一般來說，眼藥膏維持作用時間較長，但與眼藥水相比效力略差一些，故兩者應配合作用。
